明代对我国及世界药学与植物学贡献最大的本草著作。明·李时珍历时26年于万历六年（A.D.1578年）成稿，至万历二十一年（A.D.1593年）李时珍去世后始刊印。

《本草纲目》全书52卷，在内容上，共收载药物1892种，其中新增药物374种，大部分新增药物至今仍沿用；附方11000余首，其中新增8000余方；附药图1109幅。在药物分类上，打破自《神农本草经》以来的“三品”分类法，建立了较为接近自然界发展进程的分类方法，将药物分为16个部、12个大类、62类。在体例上，全书以“部”为纲，以“类”为目，具体药物以“正名”为纲，“释名”为目，结构严谨，这种“纲目”编写方法能够全面地反映各个药物的各方面情况及其本源与变化，形成了古来诸家本草远不及的独特风格。每药按释名、集解、正误、辩疑、修治、气味、主治、发明、附方、附录10项加以论述，各项内容考究严谨，既有继承、又有纠误、更有创新。

《本草纲目》的编撰参阅了经史百家著作和历代本草800多种，系统整理明以前的本草学成就，辑录和保存了大量古代药学文献，并补充了大量李时珍历经采访和亲身体验得到的经验和见解，内容丰富，堪称我国药学史上的一部巨著。该书的内容，除医药学外，还广泛涉及到生物学、矿物学、化学、环境与生物、遗传与变异、天文、地理等诸多科学领域，具有显著的“博物学”特点，也为近代自然科学的发展提供了重要的资料。如书中对植物类药物按生态、生长习性、含有物或形态的分类，基本符合由低等到高等的进化规律的动物药分类，对后世的植物分类学（曾被译为拉丁文版《中国植物志》）、生物进化论（达尔文）等产生了重大影响。该书刊行以后受到了世界各国的关注，1607年即传入日本，至今已发现有拉丁、法、德、英2、日等诸多译本流传，对世界医药学和自然科学的许多领域做出了举世公认的卓越贡献。